Đây là cách CDC sẽ theo dõi các loại virus trong mùa du lịch cuối năm

Nếu bạn đã đi du lịch ở nước ngoài gần đây, bạn có thể đã được chào đón khi trở về bằng những người ở một vài sân bay trong nước Mỹ tuyển mộ hành khách để xét nghiệm virus COVID-19. Đây là một cách đáng ngạc nhiên để theo dõi lượng COVID-19 có thể đang được đưa vào nước, thông qua hành khách, cũng như các biến thể họ đang mang đến.

Đúng lúc cho mùa du lịch bận rộn, chương trình điều hành của Trung tâm Kiểm soát và Phòng ngừa Dịch bệnh (CDC), Concentric by Ginkgo Bioworks (một công ty sinh học có trụ sở tại Boston) và XpresCheck, người tuyển dụng và xét nghiệm hành khách, đang mở rộng việc sàng lọc để bao gồm các virus khác ngoài SARS-CoV-2. Kể từ tháng 10, chương trình đã sàng lọc một tập hợp mẫu từ hành khách đối với cúm và RSV. Cuối cùng, chương trình sẽ dần bổ sung thêm 30 mầm bệnh khác.

Kể từ khi chương trình ra mắt vào năm 2021, chương trình Giám sát Di truyền của Hành khách (TGS) đã cung cấp một cửa sổ quan trọng để theo dõi cách virus COVID-19 đang lây lan, đặc biệt khi nhiều người dựa vào xét nghiệm tại nhà không yêu cầu họ báo cáo kết quả. Khoảng 6.000 hành khách đến bảy sân bay quốc tế lớn của Mỹ được xét nghiệm mỗi tuần theo nguyên tắc tự nguyện. Họ cũng cung cấp thông tin cơ bản, không xác định danh tính về nơi chuyến bay xuất phát, và các nước khác nằm trong lịch trình của họ; và trả lời các câu hỏi về tình trạng tiêm chủng, độ tuổi và liệu họ có tiếp xúc gần với ai đó xét nghiệm dương tính với COVID-19 gần đây hay không. Người ta sẽ được hỏi những câu hỏi tương tự về cúm và RSV.

Đến nay, chương trình đã đăng ký hơn 360.000 hành khách và phân tích trình tự hơn 14.000 mẫu và thêm dữ liệu này vào cơ sở dữ liệu di truyền công khai để giúp các quan chức y tế công cộng hiểu tốt hơn cách và nơi virus lây lan. TGS phát hiện trường hợp đầu tiên của biến thể BA.2.86 đến Mỹ từ một hành khách đến tại sân bay Dulles của Washington, D.C. từ Nhật Bản, ngay cả trước khi nước này phát hiện bất kỳ trường hợp nào. Đây cũng là lần đầu tiên biến thể này được tìm thấy bên ngoài Đan Mạch và Israel, nơi đầu tiên báo cáo.

“Chúng tôi đã có khá nhiều thành công với nền tảng này,” Bà Cindy Friedman, trưởng phòng Sức khỏe Duyên hải của CDC cho biết. “Hành khách có thể giúp chúng tôi lấp đầy khoảng trống trong giám sát toàn cầu bởi vì họ lây lan và lan truyền mầm bệnh khi đi du lịch. Họ cho chúng tôi một cái nhìn sớm về những gì đang được đưa vào nước, và những gì đang xảy ra trên toàn cầu.” Bởi vì không phải tất cả các nước đều có chương trình xét nghiệm và giám sát bệnh truyền nhiễm mạnh, TGS đang cung cấp thông tin quý giá không chỉ về những gì đang xảy ra ở Mỹ mà còn trên toàn thế giới.

Friedman nói cô và nhóm của mình cũng không hoàn toàn dựa vào lòng nhân đạo của hành khách để chịu khám mũi khi vừa rời chuyến bay liên lục địa dài. Kể từ khi ra mắt vào năm 2021, chương trình cũng thu thập và nghiên cứu mẫu nước thải từ máy bay, và nước thải từ ống cống chung mà máy bay thải chất thải của chúng. Việc thu thập như vậy có thể cung cấp một cách hiệu quả hơn để theo dõi các mầm bệnh đến nước, Friedman nói, bởi vì “mẫu đó đại diện cho 200 đến 300 người trên chiếc máy bay đó”. Friedman nói đội của cô cũng đang điều tra việc lấy mẫu không khí từ sân bay, có thể đẩy kiến thức của chúng ta về sự lây lan toàn cầu của các mầm bệnh xa hơn nữa.

Trong phiên bản mới nhất của chương trình, hành khách tại bốn sân bay – John F. Kennedy ở New York, Sân bay Quốc tế San Francisco, Logan ở Boston và Dulles – tình nguyện lấy dịch mũi và Ginkgo phân tích bất kỳ xét nghiệm dương tính nào tại phòng thí nghiệm của họ đối với SARS-CoV-2, cúm và RSV. Các nhà khoa học mới bắt đầu lấy mẫu nước thải để xét nghiệm cho các virus bổ sung này. Nếu các trình tự cho thấy dấu hiệu của đột biến hoặc thay đổi khác, chúng sẽ được gửi đến phòng thí nghiệm CDC ở Atlanta để phân tích sâu hơn. Giống như xét nghiệm COVID-19 ban đầu, tất cả dữ liệu di truyền đều được tải lên các cơ sở dữ liệu di truyền công khai để các nhà nghiên cứu có thể nghiên cứu chúng.

Trong những năm tới, chương trình sẽ bổ sung xét nghiệm cho hàng chục virus và vi khuẩn khác, cũng như các đột biến cho thấy virus hoặc vi khuẩn đã trở nên kháng với các phương pháp điều trị hiện có. Cuối cùng, Friedman nói đội của cô hy vọng sẽ lấy mẫu không khí từ sân bay để cung cấp thêm dữ liệu về mầm bệnh, và để tăng cường khả năng biết được mầm bệnh đến từ đâu trên thế giới, và liệu các chủng đi vào nước có gây ra bất kỳ mối đe dọa sức khỏe công cộng nào bởi các phương pháp điều trị hiện tại sẽ không thể kiểm soát chúng.

Một nhóm các mầm bệnh như vậy sẽ cuối cùng được sàng lọc bao gồm parainfluenzas, có thể góp phần vào cúm hoặc viêm phổi, và có thể nguy hiểm đối với trẻ sơ sinh. “Không có genom công khai cho một số mầm bệnh hô hấp này – không có gì cho parainfluenza 3, ví dụ, và không có gì cho virus hô hấp nhân loại – vì vậy chúng tôi sẽ nhận được các trình tự đầu tiên mà chúng tôi có thể xem xét kỹ hơn,” Casandra Philipson, nhà sinh học tính toán tại Concentric cho biết. “Chúng tôi phấn khởi về việc thiết lập một tập dữ liệu cơ sở toàn cầu cho các loại virus này. Chúng tôi càng công khai nhiều, chúng tôi có thể đóng góp nhiều hơn cho kiến thức tổng quát tốt hơn về các mầm bệnh này.”